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一个基于igv.js实现的python脚本
来源:简书 - xuzhougeng
Xu Zhougeng根据igv.js写了一个Python脚本,可以输出一个网页,然后利用Python的网页服务器打开一个端口,直接在网页上查看比对完的BAM、BigWig文件,并辅以BED或GTF注释。
代码详见:igv_web.py
运行:
python3 igv_web.py -r ref/genome.fa -w bw/*.bw -g gtf/genes.gtf
python3 -m http.server 9876